Drupal のモジュールシステムは hook という概念に基づいて設計されますので、モジュールを Drupal のコアシステムに組み込むためには hook を利用することになります。

hook は foo_bar() という名称を持った PHP の関数です。（ foo はモジュール名、bar は hook 名 ）
例えば、example.module ファイルからヘルプの表示を実行するためには、help という hook を使って、モジュールファイル内に example_help() と定義します。